Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNPDA1P46926 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms