Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDH1P40925 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDH1P40925 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDH1P40925 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDH1P40925 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDH1P40925 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDH1P40925 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDH1P40925 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDH1P40925 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDH1P40925 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDH1P40925 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDH1P40925 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDH1P40925 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDH1P40925 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDH1P40925 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDH1P40925 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDH1P40925 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDH1P40925 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDH1P40925 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDH1P40925 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDH1P40925 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDH1P40925 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDH1P40925 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MDH1P40925 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MDH1P40925 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms