Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP6V1E1P36543 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP6V1E1P36543 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms