Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRABP1P29762 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CRABP1P29762 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CRABP1P29762 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CRABP1P29762 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CRABP1P29762 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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