Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD27P26842 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD27P26842 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD27P26842 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD27P26842 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD27P26842 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD27P26842 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD27P26842 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD27P26842 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD27P26842 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD27P26842 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD27P26842 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD27P26842 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD27P26842 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD27P26842 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CD27P26842 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms