Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LMO2P25791 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LMO2P25791 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LMO2P25791 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO2P25791 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO2P25791 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO2P25791 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO2P25791 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO2P25791 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO2P25791 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO2P25791 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO2P25791 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO2P25791 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LMO2P25791 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms