Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRHP20396 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRHP20396 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRHP20396 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRHP20396 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRHP20396 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRHP20396 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRHP20396 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRHP20396 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRHP20396 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRHP20396 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRHP20396 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRHP20396 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRHP20396 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRHP20396 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRHP20396 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRHP20396 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRHP20396 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRHP20396 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRHP20396 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRHP20396 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRHP20396 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRHP20396 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRHP20396 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRHP20396 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRHP20396 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRHP20396 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRHP20396 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRHP20396 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRHP20396 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRHP20396 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRHP20396 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRHP20396 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRHP20396 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRHP20396 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRHP20396 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms