Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFRSF1BP20333 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFRSF1BP20333 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms