Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATF3P18847 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATF3P18847 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATF3P18847 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms