Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRG2P13727 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms