Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TOP2AP11388 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TOP2AP11388 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms