Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB1P11230 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms