Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RARBP10826 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RARBP10826 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RARBP10826 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RARBP10826 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RARBP10826 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RARBP10826 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RARBP10826 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RARBP10826 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RARBP10826 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RARBP10826 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RARBP10826 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RARBP10826 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RARBP10826 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RARBP10826 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RARBP10826 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RARBP10826 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RARBP10826 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RARBP10826 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RARBP10826 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RARBP10826 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RARBP10826 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms