Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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