Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CYBBP04839 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms