Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRT6BP04259 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms