Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFP01375 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFP01375 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNFP01375 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFP01375 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFP01375 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFP01375 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFP01375 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFP01375 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFP01375 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFP01375 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFP01375 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFP01375 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFP01375 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFP01375 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNFP01375 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFP01375 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNFP01375 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms