Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SEMA4FO95754 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms