Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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GABARAPO95166 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
GABARAPO95166 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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