Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPFIA3O75145 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136 ms