Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SCN2BO60939 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SCN2BO60939 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SCN2BO60939 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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