Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SYNGR3O43761 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms