Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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HOXA3O43365 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HOXA3O43365 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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