Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLOCKO15516 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms