Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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