Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms