Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSDA5PKW4 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms