Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms