Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEU3Q9UQ49 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms