Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK2Q9UPX8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHANK2Q9UPX8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms