Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNX6Q9UNH7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms