Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCML1Q9UN30 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms