Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BRPF3Q9ULD4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms