Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
RIMS3Q9UJD0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms