Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLCO3A1Q9UIG8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms