Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SH3BP4Q9P0V3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SH3BP4Q9P0V3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SH3BP4Q9P0V3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SH3BP4Q9P0V3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SH3BP4Q9P0V3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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SH3BP4Q9P0V3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SH3BP4Q9P0V3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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