Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms