Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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