Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCIQ9NVI1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCIQ9NVI1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCIQ9NVI1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCIQ9NVI1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCIQ9NVI1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCIQ9NVI1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCIQ9NVI1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCIQ9NVI1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCIQ9NVI1 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCIQ9NVI1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCIQ9NVI1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FANCIQ9NVI1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FANCIQ9NVI1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms