Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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