Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
BPESC1Q9GZL8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms