Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCGF6Q9BYE7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCGF6Q9BYE7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms