Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HDAC8Q9BY41 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms