Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC106Q9BWC9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC106Q9BWC9 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms