Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SEMA3CQ99985 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SEMA3CQ99985 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms