Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LGMNQ99538 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms