Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PCNX1Q96RV3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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