Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms