Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ5

CLIP3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, humanhuman

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP3Q96DZ5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLIP3Q96DZ5 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLIP3Q96DZ5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLIP3Q96DZ5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLIP3Q96DZ5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLIP3Q96DZ5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLIP3Q96DZ5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CLIP3Q96DZ5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CLIP3Q96DZ5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CLIP3Q96DZ5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CLIP3Q96DZ5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CLIP3Q96DZ5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CLIP3Q96DZ5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLIP3Q96DZ5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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