Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms